Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc4Q08624 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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