Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms