Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
MestQ07646 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
MestQ07646 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MestQ07646 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MestQ07646 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms