Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms