Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms