Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gfra1P97785 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms