Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

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Length 988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nbr1P97432 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nbr1P97432 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nbr1P97432 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Nbr1P97432 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nbr1P97432 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nbr1P97432 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nbr1P97432 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nbr1P97432 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nbr1P97432 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms