Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms