Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms