Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Arf1P84078 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms