Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms