Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms