Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2kP61087 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms