Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms