Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Setd4P58467 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms