Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rce1P57791 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rce1P57791 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rce1P57791 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rce1P57791 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rce1P57791 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rce1P57791 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rce1P57791 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Rce1P57791 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms