Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms