Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcstnP57716 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcstnP57716 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms