Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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