Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FanccP50652 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FanccP50652 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FanccP50652 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FanccP50652 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FanccP50652 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FanccP50652 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FanccP50652 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FanccP50652 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FanccP50652 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FanccP50652 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FanccP50652 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FanccP50652 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FanccP50652 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms