Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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PtpreP49446 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PtpreP49446 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PtpreP49446 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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PtpreP49446 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpreP49446 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpreP49446 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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PtpreP49446 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpreP49446 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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PtpreP49446 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpreP49446 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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PtpreP49446 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PtpreP49446 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PtpreP49446 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpreP49446 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpreP49446 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpreP49446 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtpreP49446 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpreP49446 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PtpreP49446 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpreP49446 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpreP49446 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpreP49446 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpreP49446 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpreP49446 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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