Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cox8bP48772 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms