Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SrprbP47758 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SrprbP47758 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SrprbP47758 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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