Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept1P42209 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms