Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
LtbP41155 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LtbP41155 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LtbP41155 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LtbP41155 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LtbP41155 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LtbP41155 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LtbP41155 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LtbP41155 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LtbP41155 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LtbP41155 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LtbP41155 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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LtbP41155 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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LtbP41155 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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LtbP41155 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtbP41155 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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