Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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Rpl28P41105 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
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