Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprkP35822 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprkP35822 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms