Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin1P35438 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms