Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms