Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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