Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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