Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ggta1P23336 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ggta1P23336 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ggta1P23336 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ggta1P23336 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ggta1P23336 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ggta1P23336 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ggta1P23336 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ggta1P23336 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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