Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms