Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms