Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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