Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms