Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms