Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms