Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms