Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cfdp1O88271 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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