Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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