Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms