Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a2O54833 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms