Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EdaO54693 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EdaO54693 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms