Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casq1O09165 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casq1O09165 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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