Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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