Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms