Protein–RNA interactions for Protein: J3QPR6

Rfpl4b, MCG1377, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfpl4bJ3QPR6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfpl4bJ3QPR6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms