Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms