Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm3443F7CCV5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3443F7CCV5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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